De vlag van Bonaire werd ingesteld op 15 december 1981. Het is rechthoekig (2:3) met schuin oplopende banen opgesteld in geel, zwart, rood, wit en blauw. De grootte en plaatsing van de kleuren en symbolen zijn vastgelegd volgens wiskundige verhoudingen.

Symbolen van de vlag:

• Cirkel: symboliseert een kompas en verwijst naar de faam van Bonaireanen als goede zeelui en vissers;
• Driehoeken: staan voor gelijkheid van mensen waar ze ook vandaan komen;
• Zespuntige ster: vertegenwoordigt de zes oorspronkelijke woonwijken op Bonaire: Kralendijk, Nikiboko, Tera Còrá, Antriol, Nort’i Saliña en Rincon;
• Rode kleur van de ster: staat voor het bloed en de overlevingskracht van de Bonaireaan;
• Gele baan: staat voor de zon en de bloemen. Het verwijst ook naar de Kibrahachaboom die na fikse regenbuien bloeit.
• Witte baan: staat voor vrede en vrijheid;
• Blauwe baan: verwijst naar de zee.